Na svim sjedištima su uspostavljani sljedeći grid posrednički sustavi:

• Globus Toolkit 4 - sustav koji je ujedno i de facto standard u izgradnji grida, pri čemu su servisi zasnovani na Web Service Resource Framework isključeni.
  

Uz osnovne servise grid posrednička sustava, na svim sjedištima instalirani su i dodatni servisi:

• Ganglia - sustav za nadzora računalnih sredstava.

Središnji poslužitelji na Srcu iskorišteni su za uspostavu središnjih servisa sljedećih sustava:

• MyProxy - sustav za pohranu i osvježavanje dugotrajnih zastupničkih certifikata
• BDII - središnji servis sustava za nadzor sredstava.

Uz grid servise na svim sjedištima su uspostavljene standardne klasterske komponente i to na način da klaster mogu ravnopravno koristiti korisnici grida i ostali korisnici klastera. Uspostavljeni alati su:

• sustavi za upravljanje poslovima Sun Grid Engine (SGE), Torque i Maui
• knjižnice za razvoj paralelnih aplikacija MPICH i MVAPICH
  
• Intel prevodioci za programske jezike Fortran i C
• Intelove matematičke knjižnice prilagođene za klastersku okolinu Math Kernel Library (MKL)
• programski paket za proračun molekulskih svojstava Gaussian (gaussian.srce.hr)
• matematičke knjižnice NAG za programski jezik Fortran (nag.phy.hr)
• grafički alat Povray (www.povray.org)
• alat za audio i video pretvorbu FFmpeg (sourceforge.net/projects/ffmpeg/)
• ABINIT - preveden s Intel prevodiocima (www.abinit.org)
• Gromacs - preveden s Intel prevodiocima i MKL knjižnicom (www.gromacs.org)
• BLAST - preveden s Intel prevodiocima (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)
• AutoDock (4.2.3) - preveden s Intel prevodiocima (http://autodock.scripps.edu)
  
• Wise (2.1.23c) (http://www.sanger.ac.uk/Software/Wise2)
  

Sjedište na Srcu pod nazivom egee.srce.hr je instalirano korištenjem klasterske distribucije Rocks i sustava za upravljanje poslovima SGE. Kako SGE nije službeno podržana platforma u EGEE gridu bilo je potrebno napraviti određena proširenja i prilagodbe grid posredničkog sustava.

Sjedište na IRB-u, egee.irb.hr, instalirano je korištenjem sustava za upravljanje poslovima Torque koji je sastavni dio grid posredničkog sustava gLite.

Sjedište na FESB-u pod nazivom egee.fesb.hr instalirano je korištenjem klasterske distribucije OSCAR.